El Consejo Regulador tiene como una de sus funciones principales tener bajo control la calidad y producción de aceite de las almazaras de la Denominación de Origen de Baena (trece entidades asociativas y seis de distinta personalidad jurídica). Además, la Denominación cuenta con veintitrés envasadoras inscritas en el Registro de Envasadores y con más de una veintena comercializadores inscritos también en los Registros del Consejo Regulador.
El Pleno Consejo Regulador es elegido por y entre los olivicultores, las cooperativas, los industriales y las envasadoras censadas.
Está formado por el presidente, vicepresidente, vocales, secretario general y un representante de la consejería de agricultura y pesca de la Junta de Andalucía.
El Pleno del Consejo Regulador se reúne a lo largo del año con el fin de tomar las decisiones de todo lo concerniente en materia económica, de promoción, ratificación de los aceites calificados, y todo lo necesario para el buen funcionamiento del Consejo Regulador de la Denominación de Origen Baena.
El Consejo Regulador cuenta con un Comité de Calificación encargado de la valoración organoléptica de los aceites que optan a conseguir la certificación del Consejo Regulador de la Denominación de Origen Baena, así como una serie de personas encargadas de realizar el control de los aceites amparados.
Presidente: D. Javier Alcalá de la Moneda Garrido
Vicepresidenta - Vocal Censo Oleicultores: Dª. María del Carmen Baena Calvo. S.C.A. Almazara de Luque
Vocal Censo Oleicultores: D. Juan Antonio Carrillo García - S.C.A. de Labradores y Ganaderos
Vocal Censo Oleicultores: D. Mariano Arroyo Camacho - S.C.A.O. Ntra. Sra. del Perpetuo Socorro
Vocal Censo Oleicultores: D. Manuel Pérez Serrano - S.C.A.O. Germán Baena
Vocal Censo Oleicultores: Casería Piedrahita, C.B. - D. Manuel Piedrahita Toro
Vocal Censo Oleicultores: Dª. María Salud Urbano Ávila - S.C.A.O. San Isidro
Vocal Censo Oleicultores: D. Manuel Priego Cubero - S.C.A.O. Ntra. Sra. de la Consolación
Vocal Censo Almazaras: S.C.A.O. Ntra. Sra. del Rosario de Nueva Carteya
Vocal Censo Almazaras: S.C.A.O. Ntra. Sra. de la Salud de Castro del Río
Vocal Censo Almazaras: S.C.A.O. Virgen de la Sierra de Cabra
Vocal Censo Almazaras: Núñez de Prado, C.B.
Vocal Censo Envasadores/Comercializadores: S.C.A.O. Ntra. Sra. de Guadalupe de Baena
Vocal Censo Envasadores/Comercializadores: Peña de Baena, S.L.U.
Vocal Censo Envasadores/Comercializadores: Cortijo de Suerte Alta, S.L.
Representante de la Delegación Territorial de Agricultura: Dª. María José Fernández Jurado
Secretario General del C.R.D.O. Baena: D. José Manuel Bajo Prados