Un grupo de olivareros defendía a principios de la década de los 70 que desde tiempos inmemoriales los aceites procedentes de la comarca de Baena habían gozado de un gran prestigio por su excelente calidad, que sin duda obedecía a la gran variedad de olivos que se cultivaban en la zona. Estos representantes del sector oleícola de la comarca, visionarios y adelantados a su tiempo, y convencidos de la calidad y singularidad de sus aceites, dieron los primeros pasos para conseguir el reconocimiento de estos solicitando la creación de una Denominación de Origen que los amparara y la creación del Consejo Regulador en el año 1971. Esto convierte a la Denominación de Origen Baena en una de las primeras iniciativas para la creación de una denominación de origen agroalimentaria en nuestro país.  

No se consiguió en ese primer intento, pero lejos de abandonar el proyecto, y más convencidos si cabe de la calidad y singularidad de su aceites, siguieron creyendo que estos merecían la obtención de un sello de calidad que los amparara y protegiese. Largo e incansable el trabajo realizado durante una década hasta que este dio sus frutos con la publicación de la Orden de 2 de Marzo de 1981, por la que se reconoce, con carácter provisional, la Denominación de Origen Baena, y se constituye su Consejo Regulador Provisional. 

A partir de ahí, y con ilusiones renovadas, más trabajo para la elaboración del Reglamento, y la creación de todas las estructuras que necesita una Denominación de Origen. Proceso que se concluiría con el reconocimiento definitivo mediante la Orden de 26 de octubre de 1987, y tras casi otra década de esfuerzos el reconocimiento oficial por la Unión Europea en 1996.

En la actualidad, nuestro Reglamento  en vigor, de fecha 5 de marzo de 2018, define al Consejo Regulador como el órgano de gestión de la Denominación de Origen Protegida Baena, siendo una corporación de derecho público, con personalidad jurídica propia, autonomía económica y plena capacidad de obrar en el cumplimiento de sus funciones.       

El Consejo Regulador, como órgano representativo de la Denominación de Origen Baena está formado por representantes titulares de olivares, almazaras o envasadoras debidamente inscritos en los correspondientes Registros.   

El Consejo Regulador tiene entre sus fines la representación, defensa, garantía, formación, investigación, desarrollo e innovación de mercados, y promoción, tanto de los productos amparados, como de la propia Denominación de Origen. Desempeña un papel fundamental en el control de la producción y la calidad de los aceites de oliva vírgenes extra amparados por la D.O. Baena., con un sistema de control que asegura que estos cumplan con los requisitos establecidos.